1978年2月底，恢复高考后水机、液压两专业招收的约140名新生入学，学制4年，教学工作迈向正规化道路。同时水力机械专业开创了甘肃工业大学招收硕士研究生的历史，学科建设上了一个层次。在这一时期，编写新教材的工作迫在眉睫。4月，第一机械工业部在天津召开“高等学校一机部对口专业座谈会”；为落实会议精神，9月我校在兰州主持召开了水力机械、液压传动专业的教材编审会议，商定由我校两专业承接编审《液压伺服控制系统》、《液压元件》、《水力机械测试技术》、《离心泵与轴流泵原理及水力设计》等全国统编教材。此后又陆续编审了《流体力学与叶栅理论》等全国统编教材，共约十七部。这些教材后续在国内高校中被广泛采用，有的教材多次修订再版，并获得全国优秀教材奖。同年，学院建成支撑水机和液压两个专业发展的实验室，包含水泵、水轮机、液压、流体力学等实验室和加工车间，部分实验室和实验设备至今仍在保留。
1980年经机械部批准学校组建两个研究室，其中一个是水力机械研究室，开创了我校设立省部级研究机构的历史；同时也建成水力机械磨蚀实验室（有水力机械过流部件材料的磨蚀转盘机试验装置、冲击型磨蚀试验装置、含沙水泵试验装置及磁致伸缩仪等），这些机构和实验室为水机专业的科研提供了良好的平台。
1981年国务院学位委员会批准我校为国内首批学士学位授予单位，其中水机、液压专业均具有学士学位授予权，流体机械及流体动力工程学科（水力机械）被国务院批准为首批硕士学位授权点，也是学校的第一个硕士学位授权点，同年流体传动与控制专业开始招收硕士研究生。这一时期，主办第一届水力机械研讨班，邀请日本东北大学教授讲学，全国水力机械领域学者参会，也开创了学校中外交流的先河。
1984年5月，学校成立了干部培训部，专司成人教育工作，并接受了有关部委和甘肃省委托举办的厂长培训教育6期，我院承担了数期水泵设计、水轮机设计和液压现代控制理论的继续教育，培养学生数百名，为全国培养了一批急需的人才。1988年，由我院主导，甘肃工业大学作为董事长单位与甘肃省水利水电勘测设计院、兰州电机厂、兰石厂铸铁分厂、兰州水泵厂、兰州阀门厂、兰州电器厂、甘肃省机械化工程公司联合成立了甘肃省黄河水利水电开发集团，为地方经济技术服务做出了贡献。
1986年许仰曾老师的项目“液压大系统模拟的性能参数数学模拟法”获批首批国家自然科学基金，也是我校第一项国家自然科学基金。
20世纪80年代，国家先后成立了全国高等院校专业教学指导委员会和教材编审委员会，我院曹鹃教授首任水力机械专业教学指导委员会主任委员，我院丁成伟教授任委员兼秘书，我校被定为主持学校。
1990年液压传动（流体传动与控制）专业批准为硕士学位授权点，后来调整为机械电子工程学科（1998年）。1991年原机械二系分解后，流体机械及工程专业成立水力机械工程系，
流体传动与控制专业成立液压气动工程系，液压实验室还获得国家教委“先进实验室”称号。
1994年，水力机械系与兰州炼油厂下属机械厂合作成立了兰州石油化工泵研究所，开发新型高温高压蜡循环泵，解决了兰州炼油厂蜡循环装置故障多发的问题。
在此期间，恢复了教师职称的评定工作，水机和液压两专业先后有13名教师评定晋升为教授（正高职）职称，还有一批教师分别评定为副教授（副高职）、讲师（中级）职称，完善了教师梯队，造就了一支勇于奋进，甘于奉献，为教学科研的发展努力工作的教师群体。
这一时期，科研工作也蓬勃开展，特别是1978年3月全国科学大会后，学院参与了一批产学研项目的研发，在服务社会、发展经济的同时也提升了教师的学术水平，并取得了一系列成果，如“水力机械的汽蚀与泥沙磨损”、“混流泵与轴流泵水力模型研制”、“径向柱塞双速液压马达”、“低速大扭矩液压马达”的研制，“径向柱塞泵”的开发研制，为青海石油机械厂设计安装调试了“高压液压泵阀实验测试台”、1200sh56/1200sh32双吸离心泵的设计、小型水电站的设计安装与人才培训等项目，由我校设计制造，与省电力局水电科研处、省电力研究所、盐锅峡水电站共同研究试验的科研成果“水力机械过流部件材料的磨蚀转盘机实验装置”已为全国多家单位所采用。值得一提的是，由水机专业教师设计、兰州水泵厂制造的1200S56和1200S32单级双吸离心泵成功应用于景泰川电力提灌二期工程，获得了国家级重点新产品，填补了该领域的国内空白。随着这些项目的完成，有十几项科技成果获奖，有九名教师为享受国务院政府特殊津贴人员，三名教师荣获机电部有突出贡献的专家或甘肃省优秀专家称号。在此期间，获发明专利数项，发表论文数十篇，学术交流多次。水机、液压两专业实验室也相继建成，其中包括水力学、水轮机、水泵、液压马达、高压阀及液压伺服系统实验台，还有一批测试仪器和设备。总资产上百万元，面积一千多平方米，基本上满足了教学科研的需要。在1978年—1995年期间水机和液压两专业的发展和取得的成绩，使其成为在国内高校中有着较大影响，位于国内高校同行前列的一流专业不仅教师队伍受到了锻炼，教学科研能力得到了提高，也为今后专业的进一步发展奠定了坚实的基础。
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